Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms