Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms