Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms