Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms