Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC5P78333 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC5P78333 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC5P78333 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC5P78333 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC5P78333 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC5P78333 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms