Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms