Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL11P62913 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL11P62913 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL11P62913 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms