Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL23P62829 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL23P62829 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL23P62829 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL23P62829 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL23P62829 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms