Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOBP62745 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RHOBP62745 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOBP62745 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms