Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA9P57773 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA9P57773 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA9P57773 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA9P57773 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA9P57773 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms