Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RRP1P56182 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RRP1P56182 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP1P56182 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP1P56182 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP1P56182 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP1P56182 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP1P56182 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms