Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACLYP53396 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACLYP53396 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACLYP53396 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACLYP53396 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACLYP53396 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACLYP53396 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACLYP53396 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACLYP53396 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACLYP53396 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms