Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YLR419WYLR419W 4308 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 PIK1YNL267W 3201 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF2P53277 IES5YER092W 378 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF2P53277 ANS1YHR126C 480 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF2P53277 TMA22YJR014W 597 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF2P53277 FCF2YLR051C 654 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YBR032WYBR032W 303 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YPR177CYPR177C 372 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF2P53277 GNT1YOR320C 1476 nt1.31□□□□□ -2.2
SYF2P53277 PEP3YLR148W 2757 nt1.31□□□□□ -2.2
SYF2P53277 FYV8YGR196C 2454 nt1.31□□□□□ -2.2
SYF2P53277 HIR3YJR140C 4947 nt1.31□□□□□ -2.2
SYF2P53277 GDS1YOR355W 1569 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF2P53277 MCM22YJR135C 720 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF2P53277 ZEO1YOL109W 342 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF2P53277 CTR9YOL145C 3234 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF2P53277 SNF5YBR289W 2718 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YCR043CYCR043C 384 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF2P53277 URM1YIL008W 300 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF2P53277 UBC7YMR022W 498 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF2P53277 ERP4YOR016C 624 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF2P53277 MON2YNL297C 4911 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YDL152WYDL152W 366 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF2P53277 PGA1YNL158W 597 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF2P53277 CDC31YOR257W 486 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YPR099CYPR099C 357 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF2P53277 SPC110YDR356W 2835 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF2P53277 CAT8YMR280C 4302 nt1.28□□□□□ -2.21
SYF2P53277 CDC25YLR310C 4770 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF2P53277 MKT1YNL085W 2493 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF2P53277 DAS1YJL149W 1992 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF2P53277 VAR1Q0140 1197 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF2P53277 SEF1YBL066C 3447 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF2P53277 CHS1YNL192W 3396 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YGR250CYGR250C 2346 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF2P53277 DOT6YER088C 2013 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF2P53277 POL5YEL055C 3069 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF2P53277 BST1YFL025C 3090 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF2P53277 MDM20YOL076W 2391 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF2P53277 CGI121YML036W 546 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF2P53277 PRM3YPL192C 402 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF2P53277 MAD1YGL086W 2250 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF2P53277 DCP2YNL118C 2913 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YBR184WYBR184W 1572 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF2P53277 HMI1YOL095C 2121 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF2P53277 PAN3YKL025C 2040 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF2P53277 SMY1YKL079W 1971 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF2P53277 RPL42BYHR141C 321 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF2P53277 RPL42AYNL162W 321 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF2P53277 SPC98YNL126W 2541 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 CBS1YDL069C 690 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 HKR1YDR420W 5409 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 TBS1YBR150C 3285 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 MSC6YOR354C 2079 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YDR509WYDR509W 348 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YGR042WYGR042W 816 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YJL015CYJL015C 285 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YNL114CYNL114C 372 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YBL071CYBL071C 309 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YNL324WYNL324W 396 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF2P53277 SEC21YNL287W 2808 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 OSH6YKR003W 1347 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YDR114CYDR114C 303 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 WIP1YDR374W-A 270 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YHL037CYHL037C 402 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 PAU18YLL064C 363 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YLR287CYLR287C 1068 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 PAU6YNR076W 363 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 YCL046WYCL046W 324 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 IRR1YIL026C 3453 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 KCS1YDR017C 3153 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF2P53277 PBY1YBR094W 2262 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YDR008CYDR008C 351 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF2P53277 SDH7YDR511W 402 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YGL239CYGL239C 315 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YKL063CYKL063C 504 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF2P53277 RPL32YBL092W 393 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF2P53277 MRPL50YNR022C 420 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF2P53277 AHC1YOR023C 1701 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF2P53277 NCA2YPR155C 1851 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF2P53277 RLM1YPL089C 2031 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YER079WYER079W 633 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF2P53277 RTT102YGR275W 474 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF2P53277 ABM1YJR108W 372 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF2P53277 DIE2YGR227W 1578 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF2P53277 TOF2YKR010C 2316 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF2P53277 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.1 ms