Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 MMS1YPR164W 4224 nt2.61□□□□□ -1.99
RTA1P53047 FKS3YMR306W 5358 nt2.61□□□□□ -1.99
RTA1P53047 YPR203WYPR203W 309 nt2.61□□□□□ -1.99
RTA1P53047 RSE1YML049C 4086 nt2.61□□□□□ -1.99
RTA1P53047 JSN1YJR091C 3276 nt2.6□□□□□ -1.99
RTA1P53047 ORC2YBR060C 1863 nt2.6□□□□□ -1.99
RTA1P53047 MNE1YOR350C 1992 nt2.6□□□□□ -1.99
RTA1P53047 SLY1YDR189W 2001 nt2.6□□□□□ -1.99
RTA1P53047 YDR426CYDR426C 378 nt2.6□□□□□ -1.99
RTA1P53047 YGR069WYGR069W 336 nt2.6□□□□□ -1.99
RTA1P53047 YIL032CYIL032C 357 nt2.6□□□□□ -1.99
RTA1P53047 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.6□□□□□ -1.99
RTA1P53047 VMR1YHL035C 4779 nt2.59□□□□□ -1.99
RTA1P53047 MUK1YPL070W 1839 nt2.59□□□□□ -1.99
RTA1P53047 SPG3YDR504C 384 nt2.59□□□□□ -1.99
RTA1P53047 ARP8YOR141C 2646 nt2.59□□□□□ -1.99
RTA1P53047 RPH1YER169W 2391 nt2.59□□□□□ -2
RTA1P53047 YCR043CYCR043C 384 nt2.58□□□□□ -2
RTA1P53047 CYC7YEL039C 342 nt2.58□□□□□ -2
RTA1P53047 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.58□□□□□ -2
RTA1P53047 UPS1YLR193C 528 nt2.58□□□□□ -2
RTA1P53047 PXA2YKL188C 2562 nt2.58□□□□□ -2
RTA1P53047 SAP1YER047C 2694 nt2.58□□□□□ -2
RTA1P53047 VPS8YAL002W 3825 nt2.58□□□□□ -2
RTA1P53047 CFT2YLR115W 2580 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 SWI5YDR146C 2130 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 TFC8YPL007C 1767 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 ALG13YGL047W 609 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 EMP24YGL200C 612 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 NOP53YPL146C 1368 nt2.57□□□□□ -2
RTA1P53047 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.56□□□□□ -2
RTA1P53047 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.56□□□□□ -2
RTA1P53047 PAU8YAL068C 363 nt2.56□□□□□ -2
RTA1P53047 TRX1YLR043C 312 nt2.56□□□□□ -2
RTA1P53047 PAU20YOL161C 363 nt2.56□□□□□ -2
RTA1P53047 COG8YML071C 1824 nt2.56□□□□□ -2
RTA1P53047 SRB8YCR081W 4284 nt2.55□□□□□ -2
RTA1P53047 HOP2YGL033W 657 nt2.55□□□□□ -2
RTA1P53047 YOR055WYOR055W 435 nt2.55□□□□□ -2
RTA1P53047 YPR063CYPR063C 423 nt2.55□□□□□ -2
RTA1P53047 YGR250CYGR250C 2346 nt2.54□□□□□ -2
RTA1P53047 CLN3YAL040C 1743 nt2.54□□□□□ -2
RTA1P53047 YFH1YDL120W 525 nt2.54□□□□□ -2
RTA1P53047 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.54□□□□□ -2
RTA1P53047 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.54□□□□□ -2
RTA1P53047 RPS17AYML024W 411 nt2.54□□□□□ -2
RTA1P53047 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.54□□□□□ -2
RTA1P53047 SSQ1YLR369W 1974 nt2.53□□□□□ -2
RTA1P53047 RFX1YLR176C 2436 nt2.53□□□□□ -2
RTA1P53047 CDC60YPL160W 3273 nt2.53□□□□□ -2
RTA1P53047 PHO91YNR013C 2685 nt2.53□□□□□ -2.01
RTA1P53047 INP2YMR163C 2118 nt2.53□□□□□ -2.01
RTA1P53047 RAD61YDR014W 1944 nt2.52□□□□□ -2.01
RTA1P53047 YLR255CYLR255C 354 nt2.52□□□□□ -2.01
RTA1P53047 LCL1YPL056C 306 nt2.52□□□□□ -2.01
RTA1P53047 ACM1YPL267W 630 nt2.52□□□□□ -2.01
RTA1P53047 PDR3YBL005W 2931 nt2.52□□□□□ -2.01
RTA1P53047 TRL1YJL087C 2484 nt2.52□□□□□ -2.01
RTA1P53047 UBR1YGR184C 5853 nt2.52□□□□□ -2.01
RTA1P53047 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
RTA1P53047 HCS1YKL017C 2052 nt2.51□□□□□ -2.01
RTA1P53047 PSD2YGR170W 3417 nt2.51□□□□□ -2.01
RTA1P53047 RPB10YOR210W 213 nt2.51□□□□□ -2.01
RTA1P53047 snR49snR49 165 nt2.51□□□□□ -2.01
RTA1P53047 VPS13YLL040C 9435 nt2.51□□□□□ -2.01
RTA1P53047 PDR11YIL013C 4236 nt2.51□□□□□ -2.01
RTA1P53047 YDR239CYDR239C 2364 nt2.51□□□□□ -2.01
RTA1P53047 YDL062WYDL062W 426 nt2.5□□□□□ -2.01
RTA1P53047 CYB5YNL111C 363 nt2.5□□□□□ -2.01
RTA1P53047 DCP2YNL118C 2913 nt2.5□□□□□ -2.01
RTA1P53047 BRP1YGL007W 378 nt2.49□□□□□ -2.01
RTA1P53047 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.49□□□□□ -2.01
RTA1P53047 NEW1YPL226W 3591 nt2.49□□□□□ -2.01
RTA1P53047 PET309YLR067C 2898 nt2.48□□□□□ -2.01
RTA1P53047 SVL3YPL032C 2478 nt2.48□□□□□ -2.01
RTA1P53047 snR70snR70 164 nt2.48□□□□□ -2.01
RTA1P53047 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.48□□□□□ -2.01
RTA1P53047 ARP7YPR034W 1434 nt2.48□□□□□ -2.01
RTA1P53047 RTT107YHR154W 3213 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 RTT101YJL047C 2529 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 YDR341CYDR341C 1824 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 snR60snR60 104 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 YRB1YDR002W 606 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 TIM9YEL020W-A 264 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 LYS14YDR034C 2373 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 SCD5YOR329C 2619 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 SLN1YIL147C 3663 nt2.47□□□□□ -2.01
RTA1P53047 INO80YGL150C 4470 nt2.46□□□□□ -2.01
RTA1P53047 SCW11YGL028C 1629 nt2.46□□□□□ -2.02
RTA1P53047 PLC1YPL268W 2610 nt2.46□□□□□ -2.02
RTA1P53047 SSD1YDR293C 3753 nt2.46□□□□□ -2.02
RTA1P53047 NAM7YMR080C 2916 nt2.46□□□□□ -2.02
RTA1P53047 LCD1YDR499W 2244 nt2.46□□□□□ -2.02
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