Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms