Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDST1P52848 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDST1P52848 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDST1P52848 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms