Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KA3P51812 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms