Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC3P51654 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC3P51654 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC3P51654 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms