Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms