Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLK1P49759 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLK1P49759 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLK1P49759 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLK1P49759 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLK1P49759 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLK1P49759 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms