Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTPAP49638 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTPAP49638 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTPAP49638 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTPAP49638 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTPAP49638 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTPAP49638 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTPAP49638 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTPAP49638 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTPAP49638 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TTPAP49638 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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