Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM4P49221 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM4P49221 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM4P49221 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM4P49221 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms