Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms