Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPL28P46779 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPL28P46779 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPL28P46779 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPL28P46779 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPL28P46779 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPL28P46779 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPL28P46779 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPL28P46779 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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RPL28P46779 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPL28P46779 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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