Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKI67P46013 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKI67P46013 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKI67P46013 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MKI67P46013 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKI67P46013 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKI67P46013 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKI67P46013 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MKI67P46013 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MKI67P46013 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms