Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC1A2P43004 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms