Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL35P42766 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL35P42766 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL35P42766 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL35P42766 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL35P42766 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL35P42766 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms