Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms