Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 PPN1YDR452W 2025 nt0.97□□□□□ -2.25
PGD1P40356 REV3YPL167C 4515 nt0.97□□□□□ -2.25
PGD1P40356 MAK10YEL053C 2202 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 HNT1YDL125C 477 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 OCA6YDR067C 675 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 PRE4YFR050C 801 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 RPL40BYKR094C 387 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 UBX4YMR067C 1251 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YOR376WYOR376W 369 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YJR029WYJR029W 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 KIP1YBL063W 3336 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YCS4YLR272C 3531 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 NST1YNL091W 3723 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 UFD2YDL190C 2886 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 SPT7YBR081C 3999 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 SHE9YDR393W 1371 nt0.96□□□□□ -2.26
PGD1P40356 LAA1YJL207C 6045 nt0.95□□□□□ -2.26
PGD1P40356 ZRG17YNR039C 1818 nt0.95□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YHL037CYHL037C 402 nt0.95□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YKL123WYKL123W 381 nt0.95□□□□□ -2.26
PGD1P40356 BER1YLR412W 825 nt0.95□□□□□ -2.26
PGD1P40356 RPS18BYML026C 441 nt0.95□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YPR099CYPR099C 357 nt0.95□□□□□ -2.26
PGD1P40356 NUP188YML103C 4968 nt0.95□□□□□ -2.26
PGD1P40356 HDA3YPR179C 1968 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 AZF1YOR113W 2745 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.94□□□□□ -2.26
PGD1P40356 SNU56YDR240C 1479 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 RAD50YNL250W 3939 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 PAN3YKL025C 2040 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YDL211CYDL211C 1119 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YDR029WYDR029W 315 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YDR509WYDR509W 348 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YGL217CYGL217C 342 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 ANS1YHR126C 480 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 TIM18YOR297C 579 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 SVS1YPL163C 783 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YPR039WYPR039W 336 nt0.93□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 SRP14YDL092W 441 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 PAU2YEL049W 363 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YOR248WYOR248W 303 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 SEC5YDR166C 2916 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 SWI5YDR146C 2130 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 SLX4YLR135W 2247 nt0.92□□□□□ -2.26
PGD1P40356 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PGD1P40356 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PGD1P40356 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PGD1P40356 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PGD1P40356 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YBR032WYBR032W 303 nt0.91□□□□□ -2.26
PGD1P40356 YPR063CYPR063C 423 nt0.91□□□□□ -2.26
PGD1P40356 NUP192YJL039C 5052 nt0.91□□□□□ -2.26
PGD1P40356 BEM2YER155C 6504 nt0.9□□□□□ -2.26
PGD1P40356 snR14snR14 160 nt0.9□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YOP1YPR028W 543 nt0.9□□□□□ -2.27
PGD1P40356 snR84snR84 550 nt0.89□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YDR008CYDR008C 351 nt0.89□□□□□ -2.27
PGD1P40356 ILM1YJR118C 612 nt0.89□□□□□ -2.27
PGD1P40356 RCN2YOR220W 798 nt0.89□□□□□ -2.27
PGD1P40356 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
PGD1P40356 DCP2YNL118C 2913 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 SMC1YFL008W 3678 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 SGO1YOR073W 1773 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 GDS1YOR355W 1569 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YER135CYER135C 393 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 HUR1YGL168W 333 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 TMA22YJR014W 597 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 SPR3YGR059W 1539 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 ROM2YLR371W 4071 nt0.88□□□□□ -2.27
PGD1P40356 TOF2YKR010C 2316 nt0.87□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.87□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YLL020CYLL020C 306 nt0.87□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YBR071WYBR071W 636 nt0.87□□□□□ -2.27
PGD1P40356 DOP1YDR141C 5097 nt0.87□□□□□ -2.27
PGD1P40356 ZIP1YDR285W 2628 nt0.86□□□□□ -2.27
PGD1P40356 MET32YDR253C 576 nt0.86□□□□□ -2.27
PGD1P40356 VPS54YDR027C 2670 nt0.86□□□□□ -2.27
PGD1P40356 MKT1YNL085W 2493 nt0.86□□□□□ -2.27
PGD1P40356 SPO75YLL005C 2607 nt0.85□□□□□ -2.27
PGD1P40356 CDC39YCR093W 6327 nt0.85□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.85□□□□□ -2.27
PGD1P40356 RTR1YER139C 681 nt0.85□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YGR025WYGR025W 303 nt0.85□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YAP3YHL009C 993 nt0.85□□□□□ -2.27
PGD1P40356 RPL9BYNL067W 576 nt0.85□□□□□ -2.27
PGD1P40356 SPO23YBR250W 1572 nt0.84□□□□□ -2.27
PGD1P40356 APQ13YJL075C 417 nt0.84□□□□□ -2.27
PGD1P40356 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.84□□□□□ -2.27
PGD1P40356 snR13snR13 124 nt0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms