Protein–RNA interactions for Protein: P38182

ATG8, Autophagy-related protein 8, yeastyeast

RIP-Chip data

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8P38182 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG8P38182 RKR1YMR247C 4689 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG8P38182 NUP145YGL092W 3954 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YML002WYML002W 2214 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG8P38182 CMS1YLR003C 876 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG8P38182 NBP1YLR457C 960 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG8P38182 SWT1YOR166C 1377 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG8P38182 GPM2YDL021W 936 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YOP1YPR028W 543 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG8P38182 SWI6YLR182W 2412 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YDL206WYDL206W 2289 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG8P38182 SMB1YER029C 591 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 MXR1YER042W 555 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YFR057WYFR057W 456 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 YBL108WYBL108W 306 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 NUT2YPR168W 474 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG8P38182 STO1YMR125W 2586 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 GEA2YEL022W 4380 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 snR5snR5 204 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YDR220CYDR220C 294 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 LRP1YHR081W 555 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YPL197CYPL197C 414 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 SCW11YGL028C 1629 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG8P38182 IES4YOR189W 351 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG8P38182 SET3YKR029C 2256 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG8P38182 SDH2YLL041C 801 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YBR012CYBR012C 420 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YPR147CYPR147C 915 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG8P38182 CDC24YAL041W 2565 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG8P38182 BI4Q0120 1917 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG8P38182 SPC2YML055W 537 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG8P38182 RUF22RUF22 515 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG8P38182 PIG1YLR273C 1947 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG8P38182 MKT1YNL085W 2493 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG8P38182 NUP157YER105C 4176 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YDL196WYDL196W 330 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG8P38182 SWF1YDR126W 1011 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YER121WYER121W 345 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YPR170CYPR170C 336 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YDL152WYDL152W 366 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 snR84snR84 550 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 QCR7YDR529C 384 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YHR054CYHR054C 1065 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 RPC10YHR143W-A 213 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 BMT5YIL096C 1011 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YLR366WYLR366W 306 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 VAM3YOR106W 852 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 PAN3YKL025C 2040 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG8P38182 KAR1YNL188W 1302 nt0.4□□□□□ -2.34
ATG8P38182 SLD3YGL113W 2007 nt0.4□□□□□ -2.34
ATG8P38182 YDR509WYDR509W 348 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YEL057CYEL057C 702 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG8P38182 ALG13YGL047W 609 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YGR045CYGR045C 363 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YGR115CYGR115C 780 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG8P38182 TIM10YHR005C-A 282 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YBR032WYBR032W 303 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YGL015CYGL015C 393 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG8P38182 RSM27YGR215W 333 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YPR096CYPR096C 303 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YPR099CYPR099C 357 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG8P38182 PDE2YOR360C 1581 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG8P38182 SNO3YFL060C 669 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YLR271WYLR271W 825 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG8P38182 SNO2YNL334C 669 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YOR199WYOR199W 330 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG8P38182 WAR1YML076C 2835 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YGL109WYGL109W 324 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YGR228WYGR228W 345 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG8P38182 ECM12YHR021W-A 456 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG8P38182 RPL38YLR325C 237 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YMR254CYMR254C 309 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG8P38182 YBR071WYBR071W 636 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG8P38182 DBP6YNR038W 1890 nt0.37□□□□□ -2.35
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