Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARGP37231 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARGP37231 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARGP37231 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms