Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP62P37198 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP62P37198 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP62P37198 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP62P37198 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP62P37198 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP62P37198 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP62P37198 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms