Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP6P35125 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP6P35125 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP6P35125 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP6P35125 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP6P35125 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP6P35125 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6P35125 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6P35125 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms