Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR5P32302 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR5P32302 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR5P32302 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR5P32302 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR5P32302 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR5P32302 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR5P32302 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR5P32302 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR5P32302 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR5P32302 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms