Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms