Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms