Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK1P29120 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms