Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD34P28906 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD34P28906 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms