Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB4P28070 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms