Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms