Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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