Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms