Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms