Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms