Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1P21675 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1P21675 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1P21675 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1P21675 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1P21675 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1P21675 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1P21675 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1P21675 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1P21675 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TAF1P21675 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TAF1P21675 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TAF1P21675 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1P21675 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1P21675 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1P21675 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms