Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNA1P20827 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms