Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDSP20132 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDSP20132 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDSP20132 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDSP20132 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDSP20132 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDSP20132 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSP20132 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDSP20132 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDSP20132 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDSP20132 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SDSP20132 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDSP20132 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDSP20132 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDSP20132 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDSP20132 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDSP20132 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSP20132 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDSP20132 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDSP20132 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms