Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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