Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARF4P18085 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF4P18085 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARF4P18085 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF4P18085 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF4P18085 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF4P18085 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF4P18085 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF4P18085 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF4P18085 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF4P18085 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF4P18085 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF4P18085 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF4P18085 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF4P18085 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms