Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB8P17481 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms